>CPU消費削減対策として、WaitForSingleObjectの待ち時間を200msecにしたので、
>例えば、計算上は200KBのデータを読み取るのに、40秒掛かってしまうようです。
たしかに，パイプが詰まっちゃいますね．
300KBくらいのファイルで試したら1分20秒かかりました．

待ち時間の短縮と，パイプにデータがある間は実行し続ける変更で数秒に短縮できました．