最適化オプションをいじっていて発見しました。
_fastcallにするとインクリメンタルサーチ時にエディタが異常終了してしまうため、
CBregExp.h、CMigemo.h のtypedefに __cedclが必要です。
例:typedef migemo* (__cdecl *Proc_migemo_open)(char* dict);
CHtmlHelp.h、CMultiMonitor.h、CPPA.hは対処済みのようです。(WINAPIが付いている)
また、my_icmpの.hと.cppは宣言が一致していません。