私の文章が具体性に欠けていたようなので、下に私が改行コードを変換する場合をあげておきます。

１、Perlによるプログラミング時にLF保存が必要
Perlの実行ファイルやデータファイル、設定ファイル等はすべてUNIX標準のEUC+LFに統一しているので、それに関係するファイルを作成する場合にLF変換します。確かに、じぇぷろ氏の言うようにFTP転送時に変換しても良いのですが、他の人にそのファイルを回すときに変換してもらわなければならなかったり、デュアルブートのUNIXから読む際にCRLFのままになってしまいます。

２、CRLFファイル⇔LFファイルの相互変換
ファイルを改行コードの変換だけしたい場合でも、中身を見ながら変換できたりするので、変換ソフトを使わずにテキストエディターで変換することもよくあります。

以上のように私は使っております。なお、２に関しては改行コード変更の上コピーして新規文書に張り付けるよりも保存時に変更できた方が利便性はあがると思います。

あと、文字コードと改行コードのセット化についてですが、げんた氏の言うとおりむやみに組み合わせない方がいいと私は思います。しかしながら、文字コードと改行コードの組み合わせがOSによってだいたい決まっているのも事実ですので検討の余地は残されていると思います。

自分から提起した話題であるのに、かなり偉そうな文面になってしまい申し訳ありません。

▼ げんたさん
> ▼ じぇぷろさん
> > EUC+LF,　SJIS?+CR(マックは良く知らない), SJIS+CRLFの組
> UNIX=EUCとは限りません。この掲示板もLinux上で動いていますが、漢字コードはSJISですし。そもそもPerl(jperlではない)は日本語ということを意識していないのでどちらを使うかは設計に依存します。
> 漢字コードと行末コードは全く異なる話なので、下手に組み合わせたりしない方がいいと思います。
UNIX=EUCしかないとはいってないんですが。

あらねこ氏>げんた氏の言うとおりむやみに組み合わせない方がいいと私は思います。

無闇に組み合わせるとも言ってはいなんです。とりあえず保存時のことだけに限定すれば、文字コードとは別に改行コードを選択できれば、一応の用は足りるでしょう。ただUNIX=EUCが標準であって、デフォルトとはそういう設定のことをいうのだからセットにするオプションをチェックしておけば文字コードにEUCを選択したとき、その下に来るであろう改行コードが自動的に[LF]選択になってくれて、選び直す手間が省ける、ということです。
LFにしたくなければそこで選び直してもいいわけです。同様にSJISを選べばCRLFになると楽。セット利用の方が実際上多いでしょうということです。そういう使い方をしたくない人はセットオプションをはずしていつも両方指定すればいいわけです。毎度のことになりますが、初心者はせいぜいUNIXファイル、Winファイルという捕らえ方なので。
せっかく読み込みや文字コード変換までできるのなら、nkfやqkcのようなことをサクラエディタで出来れば一層便利ということです。