>> フォルダ名に依存する動作ってあるのでしょうか。
私もちょっと気になりましたので便乗させてください。
ある特定のフォルダから起動した場合、タスクトレイのアイコンをクリックすると、出てきたメニューのアイコンが全て真っ黒でした。
本体のアイコンは正常に表示されています。
新規作成などのメニューも正常に動作しているみたいです。

同名のフォルダを別な場所に作りexeをコピーして起動したら、今度は普通にアイコンが表示されました。
なのでフォルダ名に依存しているわけではないのかなぁと。
起動する場所で動作(私の場合は表示だけですが)が変わるものなのでしょうか？

> exeとini以外のファイルが原因って事も。
試したフォルダにはsakura.exe以外は入っていませんでした。

解決しました。
レジストリに変な値がセットされていたのが原因のようです。お騒がせしました＆ありがとうございます。
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HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Win
dows NT\CurrentVersion\AppCompatFlags に、'C:\ProgramFiles2\sakura(初期のパス)'でWIN95 という値がセットされていました。
この結果、該当パスのsakura.exe だけが SetClipboardData の呼び出しでアクセス違反を起こしていました。このキーを削除したところ、ちゃんとこぴ＆ぺ ができました。
＃古いバージョンが動いた理由はよくわかりません。_WIN32_IE=0x300でコンパイルできなくなったのと関係があるのでしょうか。


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▼ KENCHさん
> > フォルダ名に依存する動作ってあるのでしょうか。
> 別なフォルダ（たとえばC:\Sakura）に丸ごとコピーしてうごかしてみては？
> exeとini以外のファイルが原因って事も。

結果報告
exeとiniだけ、exeと色々(bgrepやキーワード) いずれの組み合わせでもインストール先フォルダでだけエラーになりました。→sakura自体の問題
exeは、配布版、Bcc版、Bccデバッグ版、VCデバッグ版いずれもエラーでした。→コンパイルの失敗ではなさそう。
ソースを'ProgramFiles'や'sakura'で検索してもフォルダ依存するような箇所が見つからない→コードの問題ではない？
なんとなくレジストリを検索→見慣れない怪しいキーがあったので変更→大当たり。