私は、Microsoft IME2000ツールバー（アイコン）を、タスクバーに入れるのではなく、画面に表示しています。
http://makotowatana.infoseek.livedoor.com/b_general.html#kana他のソフトの時は、ちゃんと表示されますが、サクラエディタの時に、しばしば表示されなくなります。
たまに表示されることもあるので、原因解明は難しいのかもしれませんが、もし分かるようならば対応をお願いいたします。とても不便なので。
OSは、Win95,98,2000いずれの場合でも、同じ現象が発生します。
sakura 1.3.9.1です。