>非表示にしますと文字コードと行列がメニューバーに
>重なって表示されてしまいます。
重なってもメニューの表示が見えなくなるだけで，マウスカーソルを持っていけばメニュー項目が再度表示されますので，機能的な支障はないと思います．むしろ場所の有効利用になっているのかなと勝手に思っていますが．(重なり方が汚いのは改善の余地がありますが)

>これはどうにかならないでしょうか。
何が困るのかがよくわからないのですが，どうなって欲しいのでしょうか．