「外部コマンドの実行」で実行してみて
目的のアプリケーションが起動するなら
同じ操作をキーマクロで記録して、キー割り当てすれば完成。

ただしコンソールアプリケーションの場合は
cmd.exeでラッピングするなど、小細工しないと
プロセスが終了してしまうと思います。