私も現在の変換機能には大いに不満があります（かなり非一般的な物ばかりで）。

でも「この文字は変換して欲しいけど、この文字は変換しない」
とか、組み合わせの個人の要望をいちいち叶えていたら、
変換メニューの内容が無限増殖するから、よっぽど大勢から
まとまった要望が来ない限りは その手の要望はバッサリ
切り捨てられていたかと。

マクロである程度何とかするとか。

↓この手のマクロを繰り返し実行、とか。
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//キーボードマクロのファイル

S_SearchNext('[　！”＃＄％＆’（）＊＋，－．／：；＜＝＞？＠［￥］＾＿‘｛｜｝￣０-９Ａ-Ｚａ-ｚ]+', 20); // 変換対象文字を検索
S_ToHankaku(0); // 全角→半角

S_SearchNext('', 20); // 次を検索
S_Left(0); // カーソル左移動

S_CurLineCenter(0); // カーソル行をウィンドウ中央へ
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▼ ももさん
//キーボードマクロのファイル REP.MAC
//S_ToHankata(0);
S_ToHanEi(0);
S_ReplaceAll('！', '!', 128);//21
S_ReplaceAll('”', '"', 128);//22
S_ReplaceAll('＃', '#', 128);//23
S_ReplaceAll('＄', '$', 128);//24
S_ReplaceAll('％', '%', 128);//25
S_ReplaceAll('＆', '&', 128);//26
S_ReplaceAll('’', '\'',128);//27
S_ReplaceAll('（', '(', 128);//28
S_ReplaceAll('）', ')', 128);//29
S_ReplaceAll('＊', '*', 128);//2A
S_ReplaceAll('＋', '+', 128);//2B
S_ReplaceAll('，', ',', 128);//2C
S_ReplaceAll('－', '-', 128);//2D
S_ReplaceAll('．', '.', 128);//2E
S_ReplaceAll('／', '/', 128);//2F
S_ReplaceAll('：', ':', 128);//3A
S_ReplaceAll('；', ';', 128);//3B
S_ReplaceAll('＜', '<', 128);//3C
S_ReplaceAll('＝', '=', 128);//3D
S_ReplaceAll('＞', '>', 128);//3E
S_ReplaceAll('？', '?', 128);//3F
S_ReplaceAll('＠', '@', 128);//40
S_ReplaceAll('［', '[', 128);//5B
S_ReplaceAll('￥', '\\',128);//5C
S_ReplaceAll('］', ']', 128);//5D
S_ReplaceAll('＾', '^', 128);//5E
S_ReplaceAll('＿', '_', 128);//5F
S_ReplaceAll('‘', '`', 128);//60
S_ReplaceAll('｛', '{', 128);//7B
S_ReplaceAll('｜', '|', 128);//7C
S_ReplaceAll('｝', '}', 128);//7D
S_ReplaceAll('￣', '~', 128);//7E