> 従来のものより終了処理のちらつきというか，
> 滑らかさがアップしたみたいです．

あれ？ 気のせいみたいです…，
感覚的に，ワンクリックで全てのタブが
閉じられるようになったのが滑らかに感じます…
てわけで，ウソ情報でしたので撤回させてください（汗）

▼ ラスティブさん
> [共通設定]シート内の[全般]タブにあります，
> [終了の確認をする]ていうチェックボックスがあるので，
> （それをありがたく使わせていただいている者でして）
> できれば，ウインドウ右上の×印をクリックして
> 全てのタブを閉じようとするときも，
> 問い合わせてくださるとより安心感があって
> いい感じです．
現状ではどうやら[サクラエディタの全終了]の場合のみ問い合わせを出しているようです。（この場合は常駐タスクトレイアイコンも含めて終了する）
×ですべてのタブを閉じるのは[すべて閉じる]と同じ動作になるようにしているので、今のテスト版では問い合わせがありません。
特に不都合が無いようなら[すべて閉じる]でも問い合わせるようにしてみようかと思いますが、どうなのでしょう？
現在の仕様に至ったのには何か特別な経緯があるのかな？

▼ ラスティブさん
「終了の確認をする」はタスクトレイから全終了を選択したときに編集ウィンドウがあれば問合せするのが主目的のように思えます。（編集ウィンドウからならタスクトレイも閉じる問合せ）
やはり目的が違うような．．．

IE7やFireFox2には「同時に複数のタブを閉じるときは確認する」のような設定がありますね。
これと同様な設定を「終了の確認をする」とは別に追加してみました。
http://sakura.qp.land.to/?Junk%2F13
「[すべて閉じる]で他に編集用のウィンドウがあれば確認する」オプションです。
複数開いた状態では編集用ウィンドウからの[すべて閉じる]で問合せします。
ひとつだけの状態でもタスクトレイからの[すべて閉じる]では問合せします。