ANSI版からですか?
試したことないので、はっきりしたことは言えないので申し訳ないですが、
Unicode版での注意事項だけ書いてみます。
* キーワードファイル自体は、単純なルールなので、ほぼ流用できるはず。
もしかしたら、ルールが追加されているのもあるかもしれない。
* カラー設定は、新しく増えた設定項目とかはデフォルトのまま、引継ぎが可能。
* sakura.iniを流用し続けていると、新しいメニューが増えていることに気づかないことも。
例えば、メニューに「ミニマップを表示」が追加されていても、
昔からのiniを使い続けると、現れません。(そういうカスタマイズも正しいので)
たまには、iniファイルを見直すとよいかもしれません。
* iniファイルの中身を直接編集して弄ってみるのも良いかもしれません。
よく分からなければ、そのセクションを丸ごと削除してしまえば、デフォルトの設定で起動します。
単に、いろいろ試してみるとよいかも、としか言ってません。大したアドバイスできなくてごめんなさい。(*^_^*)