すみません。m(__)m
自己レスにしようとして、修正にしてしまいました。（>>unicode:833）

以下は単なる修正後の文の引用です。orz.

> ファイル／メモリどっちの入出力でも
> ・UTF-16は無変換
> ・他コードはバイナリ部をUTF-16のU+D800-D8FFに変換
> でいいと思います。
>
> ■UNICODE無変換方式（僕の案です）
>
> ●ファイル入出力
> 内部メモリ(UTF-16): 42 30 EC D8 FD D8 42 30
> ファイル(SJIS): 82 A0 EC FD 82 A0
> ※中央２バイトがバイナリで左右２バイトは'あ'
>
> ●ステータスバー表示
> 内部メモリ(UTF-16): 42 30 EC D8 FD D8 42 30
> Unicode表示: u3042 ud8ec ud8fd u3042
> SJIS表示: 82a0 ?ec ?fd 82a0
>
> ●クリップボードのデータ入出力
> 内部メモリ(UTF-16): 42 30 EC D8 FD D8 42 30
> CF-UNICODETEXT: 42 30 EC D8 FD D8 42 30
> CF-TEXT: 82 A0 EC FD 82 A0
>
>
> ■現状のパッチ（ChgCodeConv20090212b__r1524_uni）
> 上記と同じファイルで以下のようになります。
>
> ●ファイル入出力
> 内部メモリ(UTF-16): 42 30 EC D8 FD D8 42 30
> ファイル(SJIS): 82 A0 EC FD 82 A0
>
> ●ステータスバー表示
> 内部メモリ(UTF-16): 42 30 EC D8 FD D8 42 30
> Unicode表示: u3042 ?ec ?fd u3042 ★
> SJIS表示: 82a0 ?ec ?fd 82a0
>
> ●クリップボードのデータ入出力
> 内部メモリ(UTF-16): 42 30 EC D8 FD D8 42 30
> CF-UNICODETEXT: 42 30 EC FD 42 30 ★
> CF-TEXT: 82 A0 3F 82 A0 ★
>
> ★の部分がよくないです。
> 内部メモリとCF-UNICODETEXTのコードが違っているのでビューからクリップボードにコピーして検索画面の検索条件に貼り付けた文字列はもとの文字列にヒットしません。
> （範囲選択して自動的に検索条件に入力された場合には同じコードになってヒットします）
> SJISファイルとCF-TEXTは同じSJISなのに別のコードに変化してしまいました。
> ※CF-TEXTが変化してしまうようでは、「外へ持ち出すときは変換処理は欠かせない」は、まるで意味が無いですね。

> CF-TEXT: 82 A0 3F 82 A0 ★
(snip)
> SJISファイルとCF-TEXTは同じSJISなのに別のコードに変化してしまいました。

理想はCF-TEXTもSJISファイルと同じになることですが、当面はSJISでのメモリ経由インターフェースでバイナリ部分は化けてもいいと思います。
※相手がCF-UNICODETEXTをサポートしていればCF-TEXTは無視されるだけだし、仮にCF-TEXTで受け取ってもバイナリ部は与えた通りに受け取られる保証もない。
今回の、ファイルのバイナリ部が化けないようにするのと同じで、おいおい、やりたい人がやればいい（そういう人がいなければ放置していい）レベルのものだと思います。

UTF-16でのファイル入出力を無変換にしていただければ（UTF-16でのメモリ経由も従来のまま手を加えずに使えるはずなので）、ラスティブさんには当初の目的であるファイル入出力でバイナリ保持する部分とステータスバー表示あたりまで作っていただくだけで、メモリ経由のインターフェースまで手出しする必要は無くなると思います。

外部コード(通常UTF-16)⇔内部コード(変形UTF-16)などという小手先のごまかし変換を持ち込むからプログラム中に散在するあらゆる場所で「変換処理が欠かせない」になってしまうのであって、無変換なら「変換処理が必要になることは滅多にない」で済むのです。

特殊なのは、他コード⇔UTF-16変換時にバイナリをU+D800-D8FFに変換する処理だけで、他コードから変換されたU+D800-D8FFは他コードに変換するとき以外は純粋なUTF-16値として扱ってしまえば良い、です。
多くのアプリで、他コード⇒UTF-16変換時にバイナリ部を独自変換で'?'などの特定の文字に変換してそのまま'?'の文字として扱うのと同様、上記変換でUTF-16値（U+D800-D8FF）に変換してしまうことに決めているのですから。